Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usf2Q64705 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Usf2Q64705 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usf2Q64705 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms