Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Top2bQ64511 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top2bQ64511 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Top2bQ64511 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms