Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Surf4Q64310 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Surf4Q64310 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms