Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf1Q64213 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf1Q64213 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms