Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Col4a5Q63ZW6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col4a5Q63ZW6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms