Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ift52Q62559 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms