Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CochQ62507 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CochQ62507 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CochQ62507 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CochQ62507 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CochQ62507 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CochQ62507 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms