Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn4Q62472 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms