Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga3Q62470 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms