Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20809Q62458 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20809Q62458 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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