Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxa13Q62424 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa13Q62424 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms