Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SypQ62277 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SypQ62277 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SypQ62277 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SypQ62277 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SypQ62277 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SypQ62277 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SypQ62277 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SypQ62277 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SypQ62277 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms