Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Kdm5dQ62240 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Kdm5dQ62240 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm5dQ62240 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms