Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttf1Q62187 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttf1Q62187 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms