Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sema3cQ62181 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms