Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtafrQ62035 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtafrQ62035 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtafrQ62035 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PtafrQ62035 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms