Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm1Q61937 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm1Q61937 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms