Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg2Q61878 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prg2Q61878 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prg2Q61878 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg2Q61878 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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