Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Itga6Q61739 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Itga6Q61739 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itga6Q61739 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms