Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AtrxQ61687 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AtrxQ61687 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms