Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne1Q61457 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne1Q61457 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms