Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd53Q61451 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms