Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vsx2Q61412 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vsx2Q61412 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms