Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Irf9Q61179 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf9Q61179 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms