Protein–RNA interactions for Protein: Q61096

Prtn3, Myeloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prtn3Q61096 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prtn3Q61096 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prtn3Q61096 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms