Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ift20Q61025 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ift20Q61025 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms