Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik1Q60934 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grik1Q60934 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms