Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vdac3Q60931 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vdac3Q60931 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms