Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DbpQ60925 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DbpQ60925 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DbpQ60925 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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