Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf8Q60846 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf8Q60846 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms