Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cdkn2cQ60772 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdkn2cQ60772 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms