Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms