Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Foxd4Q60688 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms