Protein–RNA interactions for Protein: Q60676

Ppp5c, Serine/threonine-protein phosphatase 5, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp5cQ60676 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ppp5cQ60676 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms