Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprnQ60673 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprnQ60673 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms