Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prdm1Q60636 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms