Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms