Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CttnQ60598 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CttnQ60598 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CttnQ60598 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms