Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scaf1Q5U4C3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scaf1Q5U4C3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms