Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc42Q5SV66 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms