Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam71bQ5STT6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms