Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psme4Q5SSW2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms