Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r223Q5SSA0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r223Q5SSA0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms