Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rtp3Q5QGU6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms