Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim58Q5NCC9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim58Q5NCC9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms