Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5431Q5NCB3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5431Q5NCB3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5431Q5NCB3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5431Q5NCB3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5431Q5NCB3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms