Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ecm2Q5FW85 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ecm2Q5FW85 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms