Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prkaa1Q5EG47 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms