Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG6

Hspb6, Heat shock protein beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb6Q5EBG6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb6Q5EBG6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms