Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp22Q5DU02 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp22Q5DU02 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms